Weil SpongeBob (Stimme im Original: Tom Kenny / deutsche Stimme: Santiago Ziesmer) Mr. Krabs (Clancy Brown) beweisen will, dass er wirklich ein ganz mutiger Schwamm ist, steigt er hinab in die tiefsten Tiefen des weiten Ozeans, um sich dort dem Geist des Fliegenden Holländers (Mark Hamill), einem legendären Piraten, zu stellen.